Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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