Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms