Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms