Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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