Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms