Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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