Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAM2Q15035 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms