Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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