Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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