Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms