Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms