Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRDP23468 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRDP23468 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRDP23468 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRDP23468 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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