Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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