Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SNX13Q9Y5W8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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