Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP35Q9P2H5 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP35Q9P2H5 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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