Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGF29Q96ES7 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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