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| FXN | Q16595 | AL358472.1-201 | ENST00000431295 | 329 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AC016292.1-201 | ENST00000438344 | 235 nt | TSL 3 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | FIGNL1-202 | ENST00000395556 | 3485 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | STEAP4-201 | ENST00000301959 | 2321 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ERBIN-214 | ENST00000511297 | 4257 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | CUL3-203 | ENST00000409096 | 2701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | XIRP2-204 | ENST00000409273 | 12269 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | MTND5P7-201 | ENST00000413558 | 1798 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | TMPRSS11A-202 | ENST00000508048 | 3247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ZNF660-201 | ENST00000322734 | 5834 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AC018555.1-201 | ENST00000567548 | 1980 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | IL33-201 | ENST00000381434 | 2641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ORC4-201 | ENST00000264169 | 6598 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | FAM111B-206 | ENST00000620384 | 3405 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | SEC31A-203 | ENST00000348405 | 4012 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | PTAR1-202 | ENST00000377200 | 9876 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ROCK1P1-203 | ENST00000608049 | 2457 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | RNA5SP295-201 | ENST00000362655 | 121 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | RNY1P16-201 | ENST00000363063 | 111 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.533-201 | ENST00000384596 | 114 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | MIR585-201 | ENST00000384887 | 94 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | TRAV9-2-201 | ENST00000390441 | 394 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |