Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FXNQ16595 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FXNQ16595 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FXNQ16595 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms