Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LY6EQ16553 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms