Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZFHX3Q15911 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZFHX3Q15911 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZFHX3Q15911 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZFHX3Q15911 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZFHX3Q15911 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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