Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1AQ15573 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms