Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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