Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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