Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
UBE4AQ14139 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
UBE4AQ14139 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms