Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCINQ13939 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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CCINQ13939 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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CCINQ13939 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CCINQ13939 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCINQ13939 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCINQ13939 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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