Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CACNA1CQ13936 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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