Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTCH1Q13635 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTCH1Q13635 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTCH1Q13635 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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PTCH1Q13635 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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