Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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