Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
EIF4EBP1Q13541 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms