Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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