Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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