Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
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SKP2Q13309 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SKP2Q13309 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SKP2Q13309 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SKP2Q13309 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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SKP2Q13309 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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SKP2Q13309 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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