Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms