Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm4T1NXB5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms