Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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