Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms