Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms