Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrnQ9WU60 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms