Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms