Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp18Q9WTV6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp18Q9WTV6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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