Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms