Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gpc6Q9R087 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gpc6Q9R087 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpc6Q9R087 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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