Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkab1Q9R078 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkab1Q9R078 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms