Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms