Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms