Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx4Q9QY61 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms