Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms