Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms