Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hacl1Q9QXE0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms