Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms