Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms